RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 TTC17Q96AE7 1141 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 NELL2Q99435 816 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF14Q9UBS8 474 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.71□□□□□ -0.53
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0D9SEW6 157 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ESPNB1AK53 854 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 DFFAO00273 331 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 KDELR3O43731 214 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FGGP02679 453 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CXCR5P32302 372 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 GBE1Q04446 702 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC20A2Q08357 652 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCF15Q12870 199 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 XRCC4Q13426 336 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SERINC3Q13530 473 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRRC32Q14392 662 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 PON2Q15165 354 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 GEN1Q17RS7 908 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FUT11Q495W5 492 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 MBLAC2Q68D91 279 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 IL31Q6EBC2 164 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 AADACL2Q6P093 401 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 KDM1BQ8NB78 822 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIF18AQ8NI77 898 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FATE1Q969F0 183 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HAUS1Q96CS2 278 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ALG14Q96F25 216 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HMCESQ96FZ2 354 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 OLFM3Q96PB7 478 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRRX2Q99811 253 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPON2Q9BUD6 331 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ELOVL2Q9NXB9 296 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 DTLQ9NZJ0 730 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.7□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 NUP205Q92621 2012 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HACD1B0YJ81 288 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBX4O00257 560 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 MCF2LO15068 1137 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FANCGO15287 622 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 NNMTP40261 264 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLCN6P51797 869 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 NHLH1Q02575 133 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 IL10RBQ08334 325 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADCY2Q08462 1091 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TUBB2AQ13885 445 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 APCDD1Q8J025 514 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR7D4Q8NG98 312 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 COG1Q8WTW3 980 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HDAC11Q96DB2 347 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF599Q96NL3 588 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSGA13Q96PP4 275 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXQ1Q9C009 403 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 CIPCQ9C0C6 399 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SP110Q9HB58 689 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 VPS51Q9UID3 782 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ARHGEF3-211ENST00000486829 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms