RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TASP1Q9H6P5 420 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GDF3Q9NR23 364 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 VPS45Q9NRW7 570 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 LTBP1Q14766 1721 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 KDM1AO60341 852 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GNA12Q03113 381 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GBE1Q04446 702 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GRM3Q14832 879 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CTSAP10619 480 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM17P78536 824 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB103AP81534 67 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GAD2Q05329 585 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SGCGQ13326 291 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TEX44Q53QW1 395 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRF1Q5T601 910 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD7Q92527 254 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RAB21Q9UL25 225 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GRIN2DO15399 1336 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 INPPL1O15357 1258 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD11O43934 449 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TBX18O95935 607 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 APODP05090 189 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CCNCP24863 283 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GPR15P49685 360 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ARMC5Q96C12 935 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RAD18Q9NS91 495 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TEX28O15482 410 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 USP12O75317 370 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 RAB33AQ14088 237 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MMEL1Q495T6 779 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PCID2Q5JVF3 399 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TXNDC8Q6A555 127 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CHPFQ8IZ52 775 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NAT16Q8N8M0 369 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MAML1Q92585 1016 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM209Q96SK2 561 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PIGVQ9NUD9 493 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 WDR27A2RRH5 827 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 APOA4P06727 396 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 STMN1P16949 149 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB8P50452 374 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 STMN2Q93045 179 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA17Q96L03 361 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 NPY6RQ99463 290 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PAFAH2Q99487 392 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GABRDO14764 452 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PER2O15055 1255 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ETS1P14921 441 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 VCLP18206 1134 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HCAR3P49019 387 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CDK18Q07002 472 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SLC20A2Q08357 652 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
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