RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GDE1Q9NZC3 331 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PAK5Q9P286 719 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AMACRQ9UHK6 382 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 E2F8A0AVK6 867 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 C5orf60A6NFR6 353 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 F5H5T6 163 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 COCHO43405 550 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GCATO75600 419 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 OLFM2O95897 454 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 CCNCP24863 283 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AVPR1AP37288 418 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ADCY8P40145 1251 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ATP5OP48047 213 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CDH4P55283 916 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GUCY2DQ02846 1103 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 MTAPQ13126 283 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GPS2Q13227 327 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FZD5Q13467 585 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SLC12A1Q13621 1099 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SLMAPQ14BN4 828 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 PARP15Q460N3 678 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PPM1JQ5JR12 505 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 CHST9Q7L1S5 443 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 BBS5Q8N3I7 341 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ALLCQ8N6M5 410 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC185Q8N715 623 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SIK2Q9H0K1 926 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEH1Q9H213 219 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 OBP2AQ9NY56 170 aa7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM170AA1A519 330 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 E9PAM4 449 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SGK1O00141 431 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 DCLK1O15075 740 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RAD51CO43502 376 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 OPHN1O60890 802 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SOAT2O75908 522 aa7.19□□□□□ -1.26
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