RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PDFQ9HBH1 243 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 USP29Q9HBJ7 922 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 VPS28Q9UK41 221 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 A0A0A0MRY4 1105 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CFAP69A5D8W1 941 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 H7C0C1 242 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRIM24O15164 1050 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MTSS1O43312 755 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PEX11BO96011 259 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTAGE8P0CG41 777 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTHP32929 405 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP5OP48047 213 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SNX1Q13596 522 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GEN1Q17RS7 908 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IL31Q6EBC2 164 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCNYQ8ND76 341 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TTC8Q8TAM2 541 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RTP4Q96DX8 246 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF599Q96NL3 588 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PNKPQ96T60 521 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SPON2Q9BUD6 331 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 VPS51Q9UID3 782 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 J3KR12 359 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MATN3O15232 486 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TIMM44O43615 452 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 VAV1P15498 845 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SOX9P48436 509 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CLCN6P51797 869 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARF5P84085 180 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LMNB2Q03252 620 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SULT2A1Q06520 285 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C2orf54Q08AI8 447 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MESP2Q0VG99 397 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TMEM215Q68D42 235 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TERB1Q8NA31 727 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATL2Q8NHH9 583 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CARD6Q9BX69 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SP110Q9HB58 689 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CBX4O00257 560 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SNAP91O60641 907 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KAT7O95251 611 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CD160O95971 181 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ASLP04424 464 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GLDCP23378 1020 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RBL1P28749 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRIA2P42262 883 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KCNJ1P48048 391 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC20A2Q08357 652 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AP1B1Q10567 949 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 WASHC5Q12768 1159 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MBLAC2Q68D91 279 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RETSATQ6NUM9 610 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RNF135Q8IUD6 432 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TEX26Q8N6G2 289 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ALLCQ8N6M5 410 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EXOC4Q96A65 974 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 VAT1Q99536 393 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 IL12RB2Q99665 862 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms