RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL15Q9NXU5 204 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 DTX4Q9Y2E6 619 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 EMSYQ7Z589 1322 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM247A6NEH6 219 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 LDLRAD4O15165 306 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TGFB1I1O43294 461 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 STRNO43815 780 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 HLA-DQA2P01906 255 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SPARCP09486 303 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2D6P10635 497 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 RHAGQ02094 409 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf99Q6UX52 265 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 RANBP10Q6VN20 620 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 NEK8Q86SG6 692 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CNTROBQ8N137 903 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PLD5Q8N7P1 536 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SETD9Q8NE22 299 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PIP5K1AQ99755 562 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 Q9N2J8 555 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PEMTQ9UBM1 199 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 MAFFQ9ULX9 164 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 COL4A3Q01955 1670 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 B4DLN1 442 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP104O60308 925 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 JTBO76095 146 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 AKR1A1P14550 325 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TM4SF1P30408 202 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ICAM3P32942 547 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 IDUAP35475 653 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX10P56693 466 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ACVR2BQ13705 512 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 DHRS13Q6UX07 377 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 KLBQ86Z14 1044 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 VRK3Q8IV63 474 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 GHDCQ8N2G8 530 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CPXM2Q8N436 756 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SCAIQ8N9R8 606 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPH1Q92598 858 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 REPS1Q96D71 796 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL15Q96M94 604 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF347Q96SE7 839 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPOQ9BU64 300 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6C68A6NDL8 312 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNJ18B7U540 433 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPAN9O75954 239 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.611e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CD72P21854 359 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 NFKBIAP25963 317 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CPOXP36551 454 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CPA2P48052 419 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX2P48431 317 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 BLKP51451 505 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 MC1RQ01726 317 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CREB5Q02930 508 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB16Q05516 673 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 WTAPQ15007 396 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms