RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 RPTORQ8N122 1335 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CLDN5O00501 218 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SPTLC1O15269 473 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SERPINA6P08185 405 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6V1B2P21281 511 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FNDC5Q8NAU1 212 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 NSMCE2Q96MF7 247 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 LRMDAQ9H2I8 198 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 WDR41Q9HAD4 459 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SYBUQ9NX95 663 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 INPP4BO15327 924 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 KRT6AP02538 564 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 KRT6BP04259 564 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SLC2A4P14672 509 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 S100A5P33763 92 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 KRT6CP48668 564 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SLC1A5Q15758 541 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CYP1B1Q16678 543 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 METTL6Q8TCB7 284 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 PIF1Q9H611 641 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 HDAC3O15379 428 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 COL1A2P08123 1366 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM114B3SHH9 223 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 BTN3A1O00481 513 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 RAD51BO15315 384 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TSPAN3O60637 253 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 KRT36O76013 467 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC166P0CW27 439 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 GRIA4P48058 902 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SNX15Q9NRS6 342 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 BTBD7Q9P203 1132 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 LRRC37A3O60309 1634 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 VPS4BO75351 444 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TFAP2BQ92481 460 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 DLG3Q92796 817 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 VPS33AQ96AX1 596 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SEPHS2Q99611 448 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 DPY30Q9C005 99 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 PARVBQ9HBI1 364 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 COX4I1P13073 169 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF284Q2VY69 593 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CASP10Q92851 521 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 MYLPFQ96A32 169 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ALG9Q9H6U8 611 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 GPR25O00155 361 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 GUCA1CO95843 209 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TNS4Q8IZW8 715 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 KATNA1O75449 491 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TNFAIP8O95379 198 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 BPGMP07738 259 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ITGB6P18564 788 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FMO4P31512 558 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CD86P42081 329 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TRPC1P48995 793 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 PCYT1AP49585 367 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 CLCN5P51795 746 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 GBE1Q04446 702 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 FAM35AQ86V20 835 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 OTULINQ96BN8 352 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 COMMD8Q9NX08 183 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms