RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PRKAR1AP10644 381 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 YY1P25490 414 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TKTL1P51854 596 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PPP4CP60510 307 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PROSER1Q86XN7 944 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 DPF2Q92785 391 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 RASSF1Q9NS23 344 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SSNA1O43805 119 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ZBTB7AO95365 584 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CCR4P51679 360 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 BROXQ5VW32 411 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SYT12Q8IV01 421 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ZNF607Q96SK3 696 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ASB7Q9H672 318 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 KLK14Q9P0G3 267 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.78□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 H3BQF6 201 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 UBOX5O94941 541 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TTPAP49638 278 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 VBP1P61758 197 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AMHR2Q16671 573 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZNF276Q8N554 614 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MRASO14807 208 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MAGEC1O60732 1142 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SGPL1O95470 568 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PAEPP09466 180 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 OMPP47874 163 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DMPKQ09013 629 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATP1A4Q13733 1029 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ACTL9Q8TC94 416 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MNTQ99583 582 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PIF1Q9H611 641 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SSR3Q9UNL2 185 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 IFNGP01579 166 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 S100A6P06703 90 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ANXA5P08758 320 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 BGNP21810 368 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PSEN1P49768 467 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 Q4G0T1 1027 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TMC7Q7Z402 723 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZNF410Q86VK4 478 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 C4orf19Q8IY42 314 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ZNF609O15014 1411 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 A0A096LPK6 155 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PGRMC2O15173 223 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 OR10H2O60403 315 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SERPINB7O75635 380 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SEMA3DO95025 777 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATP6V1G2O95670 118 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 COX7A2P14406 83 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 KLRC2P26717 231 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 HUNKP57058 714 aa6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 QPRTQ15274 297 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms