RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OPTCQ9UBM4 332 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL12RB1P42701 662 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUMBP49757 651 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM187BQ17R55 369 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLITRK2Q9H156 845 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLHL31Q9H511 634 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMG20AQ9NP66 347 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MMP13P45452 471 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MFSD10Q14728 455 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF398Q8TD17 642 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTFR1LQ9H019 292 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTPRHQ9HD43 1115 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BN98 237 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIASO43766 372 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACADMP11310 421 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 JAK1P23458 1154 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKAP5P24588 427 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC38Q5VT99 294 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYT12Q8IV01 421 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF148Q8N7C7 305 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PYDC1Q8WXC3 89 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PROX1Q92786 737 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCCP43146 1447 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 E5RJQ4 531 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TYMPP19971 482 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTMR9Q96QG7 549 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DGKAP23743 735 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLT3P36888 993 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAMLD1Q13495 774 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LGI2Q8N0V4 545 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CIPCQ9C0C6 399 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLHL1Q9NR64 748 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA2Q9UM82 520 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0A0MRY4 1105 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BMM5 538 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNX3O60493 162 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNC5CO95185 931 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LBPP18428 481 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTKP33981 857 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAB1Q15750 504 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAPK11Q15759 364 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PALB2Q86YC2 1186 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AADATQ8N5Z0 425 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ART4Q93070 314 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA13Q96N96 652 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 REEP1Q9H902 201 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS51Q9UID3 782 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STX4Q12846 297 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR59Q6PJI9 974 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN3O60637 253 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POMCP01189 267 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SHBGP04278 402 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COX7A2P14406 83 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKR1A1P14550 325 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PKNOX1P55347 436 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NACC2Q96BF6 587 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F8VP50 259 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDHXO00330 501 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms