RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM4Q9C037 500 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 137.9
SH3BP1-202ENST00000417536 G3V2L1 256 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM72CH0Y354 149 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 BEST1O76090 585 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF10Q13118 480 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM72AQ5TYM5 149 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM72DQ6L9T8 149 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM72BQ86X60 149 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 APPL2Q8NEU8 664 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 JADE3Q92613 823 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGVQ9NUD9 493 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NRCAMQ92823 1304 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LTFP02788 710 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB5P36952 375 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK7P50613 346 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RABGGTBP53611 331 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FSCBQ5H9T9 825 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RASIP1Q5U651 963 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MFN1Q8IWA4 741 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 BFARQ9NZS9 450 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NEMP1O14524 444 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CLGNO14967 610 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DAB1O75553 588 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN3P26045 913 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PGGT1BP53609 377 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MED21Q13503 144 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CERCAMQ5T4B2 595 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ACAD11Q709F0 780 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM192AQ9GZU8 254 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PIRO00625 290 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA12P43365 314 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CPT1AP50416 773 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DPYSQ14117 519 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 URGCPQ8TCY9 931 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM28Q9UKQ2 775 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC78A2IDD5 438 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CA12O43570 354 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPA1O75762 1119 aa19.03■□□□□ 0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNGP07510 517 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC2P18074 760 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SAT1P21673 171 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NOS2P35228 1153 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SREBF2Q12772 1141 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DLG1Q12959 904 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX17Q15036 470 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF169Q8NCN4 708 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NPY6RQ99463 290 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 VCX3BQ9H321 246 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF186Q9NXI6 227 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNDC9O14530 226 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 AIM2O14862 343 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DCLK1O15075 740 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 AP2A1O95782 977 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRBP14927 111 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TPH1P17752 444 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR10P46092 362 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R5DQ14738 602 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NOTUMQ6P988 496 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ISL2Q96A47 359 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NMRAL1Q9HBL8 299 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF7L2Q9NQB0 619 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM13O60858 407 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1A1P14550 325 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DARSP14868 501 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MPSTP25325 297 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MTTPP55157 894 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 GRAMD1BQ3KR37 738 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM135Q86UB9 458 aa19.03■□□□□ 0.64
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