RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CYS1Q717R9 158 aa22.02■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 SGSM3Q96HU1 749 aa22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 NAT9Q9BTE0 207 aa22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 PEX11BO96011 259 aa22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC6A4P31645 630 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 TAF12Q16514 161 aa22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 J3KR12 359 aa22■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 CERCAMQ5T4B2 595 aa22■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 BANPQ8N9N5 519 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC17Q96AE7 1141 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF38Q9H0F5 515 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.98■■□□□ 1.11
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SH3BP5-204ENST00000412806 FATE1Q969F0 183 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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