RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB21Q9UL25 225 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP3K1Q13233 1512 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FGD6Q6ZV73 1430 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERBINQ96RT1 1412 aa4.04□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TET3O43151 1660 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 URADA6NGE7 173 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BTBD18B2RXH4 712 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OVOL3O00110 214 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRM8O00222 908 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMD10O75832 226 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGB1P05556 798 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR35P0CG20 571 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEPDP12955 493 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPN2P17706 415 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADORA2AP29274 412 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPHA3P29320 983 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDR1P51861 262 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPEPPSP55786 919 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIGFQ07326 219 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLMAPQ14BN4 828 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAA25Q14CX7 972 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRY2Q49AN0 593 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRT40Q6A162 431 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JADE1Q6IE81 842 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C17orf99Q6UX52 265 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALNT7Q86SF2 657 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYT12Q8IV01 421 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HSCBQ8IWL3 235 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FLAD1Q8NFF5 587 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEK9Q8TD19 979 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF653Q96CK0 615 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PGAM5Q96HS1 289 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEU1Q99519 415 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KAT14Q9H8E8 782 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THAP1Q9NVV9 213 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOS1P29475 1434 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DAPK1P53355 1430 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSH6P52701 1360 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KANK1Q14678 1352 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2QL1A1L167 161 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADAMDEC1O15204 470 aa4.02□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LIASO43766 372 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms