RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 POLG2Q9UHN1 485 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 MDM4O15151 490 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 INPP4BO15327 924 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 GRK4P32298 578 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ITIH4Q14624 930 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 USP41Q3LFD5 358 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF621Q6ZSS3 439 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CYP4X1Q8N118 509 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 LGMNQ99538 433 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 MRGBPQ9NV56 204 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 KLQ9UEF7 1012 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CDH9Q9ULB4 789 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 BTBD19C9JJ37 291 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 GRK2P25098 689 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CRABP2P29373 138 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 RABGGTBP53611 331 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FGD3Q5JSP0 725 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 MIIPQ5JXC2 388 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC149Q6ZUS6 474 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SIGLEC16A6NMB1 481 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CCL16O15467 120 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CALB2P22676 271 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 NOS3P29474 1203 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 IL5RAQ01344 420 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC153Q494R4 210 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CCNB1P14635 433 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ADRA1DP25100 572 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SLC45A4Q5BKX6 768 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 OPTCQ9UBM4 332 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SERPINE1P05121 402 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 MMP3P08254 477 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 GPR1P46091 355 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 INHBEP58166 350 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF844Q08AG5 666 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 LENG9Q96B70 501 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 HIPK3Q9H422 1215 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FAM105AQ9NUU6 356 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 HACD1B0YJ81 288 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 OR1D2P34982 312 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 COMMD2Q86X83 199 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SYT12Q8IV01 421 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FBXL16Q8N461 479 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 USP7Q93009 1102 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 UROC1Q96N76 676 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 12.2
PTPRK-207ENST00000368226 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 L1RE1Q9UN81 338 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM13O60858 407 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SHBGP04278 402 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FLT3P36888 993 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 GPR15P49685 360 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 DUSP4Q13115 394 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 CNGA2Q16280 664 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 SEMA3CQ99985 751 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 KLHL20Q9Y2M5 609 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRK-207ENST00000368226 DCXO43602 365 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 MSCO60682 206 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 AVILO75366 819 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 UMPSP11172 480 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 AMD1P17707 334 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 GABRR2P28476 465 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 WASP42768 502 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-207ENST00000368226 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms