RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 EGFRP00533 1210 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NTRK1P04629 796 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NFKB1P19838 968 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPHA3P29320 983 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARSHQ5FYA8 562 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 BTBD7Q9P203 1132 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HACD1B0YJ81 288 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHADO15335 359 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDT17P0C025 328 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOMO3P69849 1222 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAPSQ13938 189 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDR2Q16832 855 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM139Q8IV31 216 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERPINB11Q96P15 392 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SATB2Q9UPW6 733 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALDH1A2O94788 518 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 YWHAQP27348 245 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGD3Q5JSP0 725 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IQCKQ8N0W5 287 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MBOAT7Q96N66 472 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNTNA6NMZ2 147 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM24O15164 1050 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOT1P17174 413 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MMP13P45452 471 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PIGZQ86VD9 579 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NFASCO94856 1347 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MKL1Q969V6 931 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCANO14594 1321 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 IFNA14P01570 189 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOS2P35228 1153 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRIA4P48058 902 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 VGLL4Q14135 290 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF43Q68DV7 783 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM159Q96B96 161 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNFT2Q96EX2 444 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDT1Q9H211 546 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RRN3Q9NYV6 651 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLQ9UEF7 1012 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM25AB3EWG3 89 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM25CB3EWG5 89 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM25GB3EWG6 89 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PBX1P40424 430 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPSM1Q86YR5 675 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LZTR1Q8N653 840 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERAC1Q96JX3 654 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 INVSQ9Y283 1065 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 AGRPO00253 132 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FSCN2O14926 492 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 COX4I1P13073 169 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALOX12P18054 663 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CD86P42081 329 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPHB3P54753 998 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACVR2BQ13705 512 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.5□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.4
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP4AP20648 1035 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NEK3P51956 506 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 TGFB2P61812 414 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTBP1Q13363 440 aa14.49□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms