RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ALG14Q96F25 216 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf74Q96LT6 269 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SGK2Q9HBY8 427 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.151e-7■□□□□ 9.2
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PP55 124 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQJ5 194 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GIPC1O14908 333 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 TEX33O43247 280 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ATP9BO43861 1147 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SRGAP2O75044 1071 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ENDOD1O94919 500 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FSBPO95073 299 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GJB6O95452 261 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 IL1BP01584 269 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SLC8A1P32418 973 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN9P43378 593 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 KRT83P78385 493 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 PTP4A2Q12974 167 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC14Q49A88 953 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RAB6CQ53S08 254 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZVU0 165 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 MON1BQ7L1V2 547 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 STRADAQ7RTN6 431 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 AADATQ8N5Z0 425 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf20Q8ND61 904 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB124Q8NES8 71 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FRS2Q8WU20 508 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRN2Q92932 1015 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 BIRC7Q96CA5 298 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 HAPLN3Q96S86 360 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FAM129BQ96TA1 746 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 AGPAT1Q99943 283 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 OMDQ99983 421 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 MPP6Q9NZW5 540 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FZD4Q9ULV1 537 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.86□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA1BQ00975 2339 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD62A6NC57 917 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC72A6NJI9 287 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC53A6NM62 1247 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DRGXA6NNA5 263 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ALOX15BO15296 676 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SNAP91O60641 907 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CER1O95813 267 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-34P06331 123 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 KRT3P12035 628 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SRCP12931 536 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM1P13688 526 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GOT1P17174 413 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 GPD1P21695 349 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 C5AR1P21730 350 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 CD27P26842 260 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 OR1E1P30953 314 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ADPRHP54922 357 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA3BQ13214 749 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DLG2Q15700 870 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ST3GAL2Q16842 350 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ACCSLQ4AC99 568 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 ARTNQ5T4W7 220 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.85□□□□□ -1.15
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms