RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNX32Q86XE0 403 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEPT8Q92599 483 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNN1Q92952 543 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAX2Q96IS3 184 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DONSONQ9NYP3 566 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP27XA6NNY8 438 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRAK2O43187 625 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERPING1P05155 500 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYPP08247 313 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD19P15391 556 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL12RB1P42701 662 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PREPP48147 710 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUL2Q13617 745 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPARCL1Q14515 664 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS36Q86VN1 386 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD302Q8IX05 232 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HERVK_113Q902F9 699 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIOSQ9NXC5 875 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIX4Q9UIU6 781 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0U1RQF3 1178 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYT5O00445 386 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TADA3O75528 432 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFA10O95299 355 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMEP08473 750 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 P4HA1P13674 534 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSF2RAP15509 400 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYN1P17600 705 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEC24CP53992 1094 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PFKPQ01813 784 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM139Q8IV31 216 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCOCQ9UIL1 159 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C2CD2Q9Y426 696 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0U1RQJ8 604 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H3BUI4 141 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 I3L4J1 428 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTGESO14684 152 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZSCAN12O43309 604 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THAP12O43422 761 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 B3GAT3O94766 335 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC175P0C221 793 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FERP16591 822 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR1G1P47890 313 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAN2A2P49641 1150 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GATMP50440 423 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE6CP51160 858 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXO1Q12778 655 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAPTM4AQ15012 233 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms