RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf81A6NN90 581 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TJP3O95049 919 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MYBL1P10243 752 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA9P31269 272 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF4P43489 277 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 APBA1Q02410 837 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GCNT1Q02742 428 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MTAPQ13126 283 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf46Q6P387 395 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL35Q6PF15 583 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RAPH1Q70E73 1250 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF677Q86XU0 584 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STRA6Q9BX79 667 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DMAC2Q9NW81 257 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPASTQ9UBP0 616 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MYO10Q9HD67 2058 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTW7 788 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVT2 93 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GSAPA4D1B5 854 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP6O43182 974 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RTN2O75298 545 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CILPO75339 1184 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EGFP01133 1207 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AOC1P19801 751 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2ADP20671 130 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ITGALP20701 1170 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AMPD1P23109 780 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CXCR2P25025 360 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CDR2Q01850 454 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 FAF2Q96CS3 445 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 APOL2Q9BQE5 337 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DESI2Q9BSY9 194 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CYLDQ9NQC7 956 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TLDC2A0PJX2 215 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP69A5D8W1 941 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LILRB3O75022 631 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GJB6O95452 261 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PAMP19021 973 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PON1P27169 355 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NEK3P51956 506 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 ADAM17P78536 824 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PHKG1Q16816 387 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IRGCQ6NXR0 463 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WDR59Q6PJI9 974 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GAREM2Q75VX8 874 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TC2NQ8N9U0 490 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CEP76Q8TAP6 659 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK15Q8TD08 544 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MSANTD3Q96H12 275 aa4.53□□□□□ -1.68
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