RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 GPSM1Q86YR5 675 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF614Q8N883 585 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PRELID2Q8N945 189 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf42Q96LP6 360 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 OPTCQ9UBM4 332 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SELPP16109 830 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 STRADAQ7RTN6 431 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CERS2Q96G23 380 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTNAP1P78357 1384 aa16.58■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP6O75344 327 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ELNP15502 786 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 AADACL2Q6P093 401 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FSCN2O14926 492 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 UBOX5O94941 541 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GOT1P17174 413 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA3CQ99985 751 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD7Q9P203 1132 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZW10O43264 779 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CES1P23141 567 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP2A13Q16696 494 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL15Q9NXU5 204 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF8P28908 595 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL2P36404 184 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN5P51795 746 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 THOP1P52888 689 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SKP1P63208 163 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 STARD8Q92502 1023 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NLNQ9BYT8 704 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN5O00501 218 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TBL1XO60907 577 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LAG3P18627 525 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 IGFBP4P22692 258 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP8P22894 467 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC25CP30307 473 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1D2P34982 312 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DSG1Q02413 1049 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 XRCC4Q13426 336 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MICU2Q8IYU8 434 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MAML3Q96JK9 1138 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPER2Q96P56 530 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB8Q9H765 288 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R3G1 203 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FCHO1O14526 889 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD2P08910 425 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TTPAP49638 278 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DDR2Q16832 855 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 QSOX1O00391 747 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC22BO75396 215 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF9O75901 435 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF682O95780 498 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CACUL1Q86Y37 369 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 USP6NLQ92738 828 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PADI3Q9ULW8 664 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM50BQ9Y247 325 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNA5O15131 536 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ASGR1P07306 291 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD23AP54725 363 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms