RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327443.8

SP1-201, Transcript of Sp1 transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SP1, Length 2,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1-201ENST00000327443 ASB14A6NK59 587 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 POU2F1P14859 743 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 IDUAP35475 653 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CDKL1Q00532 357 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DGKZQ13574 1117 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 GPR107Q5VW38 600 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TBATAQ96M53 351 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 STRA6Q9BX79 667 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 POLE4Q9NR33 117 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 A0A087X0T9 212 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 AURKAO14965 403 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC22A1O15245 554 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PSAPP07602 524 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RRM2P31350 389 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NUDT1P36639 197 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAPK10P53779 464 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 KCTD2Q14681 263 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 LRRC41Q15345 812 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NSMFQ6X4W1 530 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZNF398Q8TD17 642 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FRS2Q8WU20 508 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TRIM63Q969Q1 353 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DCLK3Q9C098 648 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.99□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZNF839A8K0R7 811 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 A8MUA0 341 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MEI4A8MW99 385 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TSPAN4O14817 238 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ACOX3O15254 700 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SHOXO15266 292 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NDUFA2O43678 99 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ALDH1A2O94788 518 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 GSTM2P28161 218 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ETV1P50549 477 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CDK16Q00536 496 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CREB5Q02930 508 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 NME3Q13232 169 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TMED2Q15363 201 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 BEND5Q7L4P6 421 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 KRT77Q7Z794 578 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TPH2Q8IWU9 490 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FANK1Q8TC84 345 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 RMND5AQ9H871 391 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 EMC3Q9P0I2 261 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 FAM187AA6NFU0 413 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 H0YCG3 227 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 PDXKO00764 312 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 DNAJB5O75953 348 aa9.98□□□□□ -0.81
SP1-201ENST00000327443 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms