RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CYP4F11Q9HBI6 524 aa28.55■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa28.55■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 PDE5AO76074 875 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 FYNP06241 537 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 LRPAP1P30533 357 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SNX17Q15036 470 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ACAD11Q709F0 780 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 LCA5Q86VQ0 697 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 RNF169Q8NCN4 708 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 OXSMQ9NWU1 459 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 GABRDO14764 452 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB14O43829 449 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 GLDCP23378 1020 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 DNAJB2P25686 324 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CD68P34810 354 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 MTTPP55157 894 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ARL13BQ3SXY8 428 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CST9Q5W186 159 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 STON2Q8WXE9 905 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 AZIN2Q96A70 460 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 MFSD3Q96ES6 412 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 PGLYRP2Q96PD5 576 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 KLHL4Q9C0H6 718 aa28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 LOC100653049A0A140TA62 436 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K13O43283 966 aa28.53■■■□□ 2.16
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UBP1-201ENST00000283628 F2P00734 622 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K7CLP57077 242 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 DAOAP59103 153 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 IRF9Q00978 393 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 GALNT2Q10471 571 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 VPS39Q96JC1 886 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CAB39LQ9H9S4 337 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 TCF7L2Q9NQB0 619 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.53■■■□□ 2.16
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UBP1-201ENST00000283628 RRN3Q9NYV6 651 aa28.53■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 NRP1O14786 923 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SERPINB6P35237 376 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CERCAMQ5T4B2 595 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 PHC3Q8NDX5 983 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CNDP1Q96KN2 507 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 GBP5Q96PP8 586 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 E9PBE3 544 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 KLHL41O60662 606 aa28.52■■■□□ 2.16
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UBP1-201ENST00000283628 RNF111Q6ZNA4 994 aa28.52■■■□□ 2.16
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UBP1-201ENST00000283628 TMEM40Q8WWA1 233 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 RAP2CQ9Y3L5 183 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 IPPQ9Y573 584 aa28.52■■■□□ 2.16
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A2O15244 555 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 ATP9BO43861 1147 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 GNAT1P11488 350 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 DLG2Q15700 870 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 WSCD1Q658N2 575 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 HPS6Q86YV9 775 aa28.51■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 GPR22Q99680 433 aa28.51■■■□□ 2.15
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UBP1-201ENST00000283628 THRAP10827 490 aa28.5■■■□□ 2.15
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UBP1-201ENST00000283628 DNAJB1P25685 340 aa28.5■■■□□ 2.15
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UBP1-201ENST00000283628 ZYG11AQ6WRX3 759 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 MAPK15Q8TD08 544 aa28.5■■■□□ 2.15
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UBP1-201ENST00000283628 MATN2O00339 956 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 PSMD3O43242 534 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 PEX1O43933 1283 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 F9P00740 461 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 CDH17Q12864 832 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 PRPSAP1Q14558 356 aa28.5■■■□□ 2.15
UBP1-201ENST00000283628 MORN1Q5T089 497 aa28.5■■■□□ 2.15
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