RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLK2Q9NYY3 685 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F5H5T6 163 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSD17B3P37058 310 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPS2Q13227 327 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPWQ8N729 165 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HPS4Q9NQG7 708 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MPP6Q9NZW5 540 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C5orf60A6NFR6 353 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMAPO00193 183 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GFRA2O00451 464 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCATO75600 419 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAV1P15498 845 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MX2P20592 715 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PMS2P54278 862 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOOK3Q86VS8 718 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LGMNQ99538 433 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTN5O94779 1100 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP17A1P05093 508 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHKAP35790 457 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRLP54845 237 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALNT2Q10471 571 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC25Q86WR0 208 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQCKQ8N0W5 287 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPXM2Q8N436 756 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LZTR1Q8N653 840 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPT1BQ92523 772 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OGFRQ9NZT2 677 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASH4PA8MWX3 477 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHADO15335 359 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP1B1Q10567 949 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHCR24Q15392 516 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALFQ53S48 1182 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC31Q6UY01 552 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNYQ8ND76 341 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDI1Q8WTU0 396 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRF7Q92985 503 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDAC11Q96DB2 347 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTUB2Q96DC9 234 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZIM3Q96PE6 472 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLC2Q9H0B6 622 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRD9Q9H8M2 597 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBL1XO60907 577 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDGFRLQ15198 375 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANO4Q32M45 955 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NETO2Q8NC67 525 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUFY1Q96T51 708 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F5P12259 2224 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0A0MRY4 1105 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARNTLO00327 626 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms