RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 GRM5P41594 1212 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 RNF148Q8N7C7 305 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PKP2Q99959 881 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 NUF2Q9BZD4 464 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PLK2Q9NYY3 685 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TMCO1Q9UM00 188 aa15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TNFAIP8O95379 198 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PIGNO95427 931 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 AP2A1O95782 977 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SBK3P0C264 359 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PTPN3P26045 913 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 GRIA4P48058 902 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 INHBCP55103 352 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CDKL1Q00532 357 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MPP3Q13368 585 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TMEM198Q66K66 360 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 NLRP7Q8WX94 980 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CATSPER2Q96P56 530 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CASS4Q9NQ75 786 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 BFARQ9NZS9 450 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MCM3APO60318 1980 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC22A2O15244 555 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CAPNS1P04632 268 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ATP6V1B1P15313 513 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TFEBP19484 476 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 LMO2P25791 158 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MYLK3Q32MK0 819 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 LIPMQ5VYY2 423 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 IYDQ6PHW0 289 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 KCNMB4Q86W47 210 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 VPS39Q96JC1 886 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 COX16Q9P0S2 106 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.2■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TIMM44O43615 452 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CNMDO75829 334 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PYGLP06737 847 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 RANBP1P43487 201 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ACADSBP45954 432 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CSRP3P50461 194 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PGGT1BP53609 377 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DPYSQ14117 519 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 MARK4Q96L34 752 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 TASP1Q9H6P5 420 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 WDR41Q9HAD4 459 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SNTG2Q9NY99 539 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DCLK1O15075 740 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 ME2P23368 584 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 APOFQ13790 326 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 USP41Q3LFD5 358 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DCAF6Q58WW2 860 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 PAOXQ6QHF9 649 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.19■□□□□ 0.02
SYP-201ENST00000263233 DLG3Q92796 817 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms