RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.63■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRID2O43424 1007 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM13O60858 407 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 VAPBO95292 243 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNTFP26441 200 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 APOFQ13790 326 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKDD1AQ495B1 522 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 AHI1Q8N157 1196 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF567Q8N184 647 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF711Q9Y462 761 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACKR2O00590 384 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 CKMT2P17540 419 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PROZP22891 400 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDST2P52849 883 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 APBA2Q99767 749 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMC3P17980 439 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TFEBP19484 476 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOX11P35716 441 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTX3Q5HYI7 312 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF280DQ6N043 979 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC39A3Q9BRY0 314 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF181Q9P0P0 153 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.62■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYL4P12829 197 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 IER5Q5VY09 327 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 URGCPQ8TCY9 931 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINI1Q99574 410 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MATN2O00339 956 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ME2P23368 584 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 C16orf89Q6UX73 402 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBBP8Q99708 897 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 STRNO43815 780 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLBP06746 335 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT1A6P19224 532 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENTPD1P49961 510 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLC3Q6P597 504 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTUD5Q96G74 571 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 EVPLQ92817 2033 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEMP2A6NFY4 417 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MDM4O15151 490 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGK2P07205 417 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SBK3P0C264 359 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELP3Q9H9T3 547 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.6■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A087WZ62 844 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUPT3HO75486 399 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 VTNP04004 478 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMD7P51665 324 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPK10P53779 464 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRM3Q14832 879 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPYSL2Q16555 572 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 SULF1Q8IWU6 871 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.59■■□□□ 1.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms