RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ELMOD1Q8N336 334 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 HEY2Q9UBP5 337 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 FSHRP23945 695 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM50BQ9Y247 325 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 CD19P15391 556 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC18A2Q05940 514 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf91Q3C1V1 193 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 MCUR1Q96AQ8 359 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 GSTA2P09210 222 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 PPFIBP2Q8ND30 876 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF212Q9UDV6 495 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF4P15884 667 aa26.93■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 NEK3P51956 506 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA5P54756 1037 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB16Q05516 673 aa26.93■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 TTC39CQ8N584 583 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL9Q8TC94 416 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf48Q96LL4 319 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTN4Q9UJW0 460 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JND7 137 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DPPA5A6NC42 116 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB3Q9Y575 518 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC16A6NMB1 481 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 F8W8V4 182 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 H0Y3Z8 333 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDC25CP30307 473 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 OGDHQ02218 1023 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAP1Q15027 740 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 TAF12Q16514 161 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 UBA3Q8TBC4 463 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa26.91■■□□□ 1.9
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