RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim62Q80V85 475 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp398Q8BV16 643 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpina3bQ8BYY9 420 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlk1Q8C0V0 766 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClmnQ8C5W0 1052 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1416Q8VGU4 312 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim7Q923T7 510 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddit4Q9D3F7 229 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spint1Q9R097 507 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klf6O08584 283 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3r2O08908 722 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SagP20443 403 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp512bQ6PHP4 879 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam39Q7M762 756 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rimbp2Q80U40 1072 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slfn5Q8CBA2 884 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim61Q8JZK6 461 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PvrQ8K094 408 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo21Q8VDH1 627 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Caap1Q8VDY9 356 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn22Q9D7U6 220 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmbim4Q9DA39 238 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efcab9Q9DAM2 216 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cacng3Q9JJV5 315 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nphs1Q9QZS7 1256 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox3fA2ANE1 215 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CflarO35732 481 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brcc3P46737 291 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Als2clQ60I26 952 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DbhQ64237 622 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Deup1Q7M6Y5 601 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb41Q811F1 908 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NeproQ8R2U2 564 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zcchc14Q8VIG0 956 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcg3Q99P81 650 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D979 236 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcp11x2A2AEI7 503 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akap5D3YVF0 745 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam47eD3YWC7 402 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfr2E9Q5M4 874 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B3gat3P58158 335 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ksr1Q61097 873 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clptm1lQ8BXA5 539 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DrgxQ8BYH0 263 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam78aQ8C552 283 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atpaf2Q91YY4 289 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rev1Q920Q2 1249 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc8a3S4R2P9 928 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl41A2AUC9 606 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CcnoP0C242 352 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stmn2P55821 179 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbp2P70695 339 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itih3Q61704 889 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Far2Q7TNT2 515 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naa25Q8BWZ3 972 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl2Q8JZP3 593 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr449Q8VGW8 311 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Creld1Q91XD7 420 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep83Q9D5R3 692 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PigqQ9QYT7 581 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3739L7N296 216 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ift81O35594 676 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alas2P08680 587 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csrp3P50462 194 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v0d1P51863 351 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsmem1Q3UQS2 128 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc8bQ5DU41 803 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tas2r129Q7M709 320 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gprc5aQ8BHL4 356 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ston2Q8BZ60 895 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco4a1Q8K078 723 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npffr2Q924H0 417 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhrs1Q99L04 313 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts9E9PUN6 1931 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grik3B1AS29 919 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr310B2RVZ1 332 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8369E9PZI3 166 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdelc2G5E897 503 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn1lP0C7T6 687 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsta3P23591 321 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fen1P39749 378 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kir3dl1P83555 432 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.1 ms