RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641584.1

CASC19-242, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 2,114 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-242ENST00000641584 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RLFQ13129 1914 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.7□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 BTBD19C9JJ37 291 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 F5H6K3 240 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CEP104O60308 925 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ADAMTS4O75173 837 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ABHD16AO95870 558 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SPARCP09486 303 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TPBGLP0DKB5 382 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CETPP11597 493 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MALP21145 153 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 PSMA5P28066 241 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 NT5C2P49902 561 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CASP9P55211 416 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 COG7P83436 770 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KLRC3Q07444 240 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KIF5AQ12840 1032 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KCNAB2Q13303 367 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 C11orf88Q6PI97 169 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TMEM270Q6UE05 265 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 Q6ZUG5 572 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 Q6ZVL8 140 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RUFY3Q7L099 469 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 USP38Q8NB14 1042 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KCNN1Q92952 543 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MECRQ9BV79 373 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 LDAHQ9H6V9 325 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SH2D4AQ9H788 454 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KAT14Q9H8E8 782 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 DERAQ9Y315 318 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 A0A0G2JPF8 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ERICH2A1L162 156 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TSC22D2O75157 780 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MST1P26927 711 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ACTR1AP61163 376 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TEKQ02763 1124 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 DEUP1Q05D60 604 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SLFN13Q68D06 897 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KCTD1Q719H9 257 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 DPP10Q8N608 796 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 ST7LQ8TDW4 575 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 WHAMMQ8TF30 809 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RAB7BQ96AH8 199 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 C12orf42Q96LP6 360 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 GPR20Q99678 358 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FUZQ9BT04 418 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 TMEM206Q9H813 350 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CHST7Q9NS84 486 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.69□□□□□ -1.5
CASC19-242ENST00000641584 CNIH4Q9P003 139 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms