RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637089.1

EFHC1-227, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EFHC1, Length 2,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-227ENST00000637089 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 AHI1Q8N157 1196 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.66□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 FAM170BA6NMN3 283 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 RAMP2O60895 175 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 MAP3K6O95382 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 DRD1P21728 446 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 GBE1Q04446 702 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 SLC12A1Q13621 1099 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ODF2Q5BJF6 829 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 KAZNQ674X7 775 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 MBLAC2Q68D91 279 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 TTC17Q96AE7 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 HMCESQ96FZ2 354 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 MUC3BQ9H195 1237 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 RASA4BC9J798 803 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 TNFRSF10AO00220 468 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 RASA4O43374 803 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 MFSD11O43934 449 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 SNAP91O60641 907 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ZMPSTE24O75844 475 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 CXCR5P32302 372 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 TNFRSF4P43489 277 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 NDST2P52849 883 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 COPS2P61201 443 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 PPP2R5EQ16537 467 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 PTPRNQ16849 979 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 NPNTQ6UXI9 565 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 PJA1Q8NG27 643 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 MAGEH1Q9H213 219 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 VPS28Q9UK41 221 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.65□□□□□ -0.06
EFHC1-227ENST00000637089 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 TMEM221A6NGB7 291 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 M0R296 226 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 KCNK3O14649 394 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 PI15O43692 258 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CST8O60676 142 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CD160O95971 181 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 PTPN7P35236 360 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 SEC13P55735 322 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 DYNLT1P63172 113 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 GAS6Q14393 721 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 Q6ZS52 159 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 RFX6Q8HWS3 928 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 FLCNQ8NFG4 579 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 MYO19Q96H55 970 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 ACOX2Q99424 681 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 SPON2Q9BUD6 331 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CIPCQ9C0C6 399 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 DTLQ9NZJ0 730 aa14.64□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 MT-CO1P00395 513 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 OXCT1P55809 520 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 ARF5P84085 180 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 SERINC3Q13530 473 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 DMC1Q14565 340 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 LZTR1Q8N653 840 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CARD9Q9H257 536 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 VPS51Q9UID3 782 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 WASH3PC4AMC7 463 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 CBX4O00257 560 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 STK25O00506 426 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 APOL1O14791 398 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 RNF40O75150 1001 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-227ENST00000637089 TIE1P35590 1138 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms