RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	MROH8	Q9H579	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	INPPL1	O15357	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	STRN	O43815	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PLAU	P00749	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LYL1	P12980	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	MTNR1A	P48039	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CDH15	P55291	814 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538		A0A1W2PPH5	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RRH	O14718	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LCK	P06239	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TGFB2	P61812	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RHAG	Q02094	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	MTA1	Q13330	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	EYA3	Q99504	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	SPTLC2	O15270	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	TYK2	P29597	1187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	CHRNA5	P30532	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	CCR9	P51686	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	PLK5	Q496M5	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EP300-208	ENST00000635538	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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