RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 HAUS1Q96CS2 278 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PWWP2AQ96N64 755 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 KCNH6Q9H252 994 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 EBF3Q9H4W6 596 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 LEFTY2O00292 366 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ALOX15BO15296 676 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 COCHO43405 550 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SLCO1A2P46721 670 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 IFNAR2P48551 515 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF77Q15935 545 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 HSPH1Q92598 858 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TULP2O00295 520 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TLR5O60602 858 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CDH16O75309 829 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ETS1P14921 441 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CHN1P15882 459 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN9P43378 593 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SOX9P48436 509 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RGS7P49802 495 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TUBP50607 506 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NUBP1P53384 320 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RUNX3Q13761 415 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DPYSL3Q14195 570 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PDGFRLQ15198 375 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TAF5Q15542 800 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PRSS33Q8NF86 280 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RIN3Q8TB24 985 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PPCSQ9HAB8 311 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 EURLQ9NYK6 297 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MCF2LO15068 1137 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MDM4O15151 490 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 GABBR2O75899 941 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 OLFM2O95897 454 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SDC4P31431 198 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ACADSBP45954 432 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TKTL1P51854 596 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DYNLT1P63172 113 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NOMO1Q15155 1222 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TDRPQ86YL5 185 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MDM1Q8TC05 714 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CALN1Q9BXU9 219 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 USP3Q9Y6I4 520 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQH9 124 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PGFP49763 221 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PSEN1P49768 467 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CDH6P55285 790 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CORO7P57737 925 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZXDBP98169 803 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CBLBQ13191 982 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RASA2Q15283 850 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CENPUQ71F23 418 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FAM122AQ96E09 287 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MSANTD3Q96H12 275 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 HSFY1Q96LI6 401 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RNF157Q96PX1 679 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.11■■□□□ 1.13
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