RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	KLF10	Q13118	480 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	SLC14A1	Q13336	389 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	MTX1	Q13505	466 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	DOK3	Q7L591	496 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	FNBP1	Q96RU3	617 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	MNT	Q99583	582 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	STK39	Q9UEW8	545 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	HIVEP1	P15822	2718 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	TSPY2	A6NKD2	308 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM12	O43184	909 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	FIBP	O43427	364 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	KDM1A	O60341	852 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ULK1	O75385	1050 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	GPR32	O75388	356 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	OFD1	O75665	1012 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	POMC	P01189	267 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	PDHB	P11177	359 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	GJA1	P17302	382 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	GNAT2	P19087	354 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.54	1e-6	■■■■■ 42.2
MLH1-223	ENST00000616768	KLRC1	P26715	233 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	DCT	P40126	519 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	CCR2	P41597	374 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	TDO2	P48775	406 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	SESN3	P58005	492 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCD2	Q92925	531 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	PCYT2	Q99447	389 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	IL21R	Q9HBE5	538 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	STARD5	Q9NSY2	213 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	ING3	Q9NXR8	418 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MLH1-223	ENST00000616768	CHAD	O15335	359 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	KLK10	O43240	276 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	JUP	P14923	745 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ITGB6	P18564	788 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	HOXA9	P31269	272 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ACTN2	P35609	894 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	HSD17B4	P51659	736 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	UCN	P55089	124 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A3	Q00325	362 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	FHL2	Q14192	279 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	SYT13	Q7L8C5	426 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	CEP76	Q8TAP6	659 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	URGCP	Q8TCY9	931 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	USP7	Q93009	1102 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	LENG9	Q96B70	501 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	TTC1	Q99614	292 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
MLH1-223	ENST00000616768	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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