RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613673.4

ACP6-208, Transcript of acid phosphatase 6, lysophosphatidic, human

TSL 1 (best)

Gene ACP6, Length 4,564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACP6-208	ENST00000613673	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	BORCS6	Q96GS4	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CAPN10	Q9HC96	672 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	COL1A2	P08123	1366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673		F5H5T6	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	VNN1	O95497	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	GLP2R	O95838	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CLPTM1	O96005	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CDC25C	P30307	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MATK	P42679	507 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PIGN	O95427	931 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PIGR	P01833	764 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CREB1	P16220	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	GOT1	P17174	413 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CYP2C18	P33260	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SERPINA6	P08185	405 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TJP1	Q07157	1748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RAG1	P15918	1043 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	GABRB2	P47870	512 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RFX3	P48380	749 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ARL4D	P49703	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	USP6NL	Q92738	828 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	RBBP8	Q99708	897 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	KRT36	O76013	467 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CRTAM	O95727	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	BDNF	P23560	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TUB	P50607	506 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	LGMN	Q99538	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	DERA	Q9Y315	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	MSC	O60682	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	ALB	P02768	609 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	TPSB2	P20231	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	SCNN1G	P51170	649 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACP6-208	ENST00000613673	NAGLU	P54802	743 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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