RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 HOOK3Q86VS8 718 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS7Q8IWZ6 715 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO25Q8TCJ0 367 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ING5Q8WYH8 240 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CAVIN3Q969G5 261 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SHOC2Q9UQ13 582 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOFQ9NZM1 2061 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ILVBLA1L0T0 632 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF103O00237 685 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CES5AQ6NT32 575 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 NETO2Q8NC67 525 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM3Q96MP5 696 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MTCH2Q9Y6C9 303 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MATN3O15232 486 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF12O95522 483 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 WASHC5Q12768 1159 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CTC1Q2NKJ3 1217 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RHBDF2Q6PJF5 856 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP128Q6ZU80 1094 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NPAS3Q8IXF0 933 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIL6Q8IXY8 311 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NEUROG2Q9H2A3 272 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN3O60637 253 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TBL1XO60907 577 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CYBBP04839 570 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN3P26045 913 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FDFT1P37268 417 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX44Q53QW1 395 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ATAT1Q5SQI0 421 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC110Q8TBZ0 833 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 HMCESQ96FZ2 354 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TP73O15350 636 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SGSHP51688 502 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 GNA12Q03113 381 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SERINC3Q13530 473 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF43Q68DV7 783 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRN4Q8WUT4 740 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 OBP2AQ9NY56 170 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT10Q9P0V9 454 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK1O00180 336 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CHADO15335 359 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
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CAPNS1-206ENST00000588815 OXCT1P55809 520 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IL10RBQ08334 325 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 COL19A1Q14993 1142 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF567Q8N184 647 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MAML1Q92585 1016 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF13Q92913 245 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
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CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC1BQ9P126 229 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF9Q9P2J2 1179 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNB1P14635 433 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEA6P43360 314 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NRLP54845 237 aa31.72■■■□□ 2.67
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC16Q8NEE8 873 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 DDI1Q8WTU0 396 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NSMCE1Q8WV22 266 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CPT1BQ92523 772 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPOR3Q96MK2 946 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 IL12RB2Q99665 862 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SP110Q9HB58 689 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPV4Q9HBA0 871 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PID1Q7Z2X4 250 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT8LQ8N9F0 302 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCD2Q92925 531 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC4Q96A65 974 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TEKT5Q96M29 485 aa31.72■■■□□ 2.67
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