RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SIN3B	O75182	1162 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	EFEMP2	O95967	443 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF12	P17014	697 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CDH3	P22223	829 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ADRA1D	P25100	572 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	FNDC8	Q8TC99	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928		M0QYV0	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC22	O60826	627 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ORC1	Q13415	861 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	LPIN1	Q14693	890 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RASA4B	C9J798	803 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RASA4	O43374	803 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	UGT1A9	O60656	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SPAG6	O75602	509 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ELK3	P41970	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DYNLT1	P63172	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	NCSTN	Q92542	709 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	GYG2	O15488	501 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	AVIL	O75366	819 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	BEST1	O76090	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ETS2	P15036	469 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	KRT15	P19012	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	PSMA3	P25788	255 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	STIL	Q15468	1287 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DGKD	Q16760	1214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	EME1	Q96AY2	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CLPTM1	O96005	669 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	S100A5	P33763	92 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CRHR1	P34998	444 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	CENPU	Q71F23	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-208	ENST00000587928	IDH3B	O43837	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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