RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582453.5

MSI2-215, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-215	ENST00000582453	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	ABCC4	O15439	1325 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	RTL9	Q8NET4	1388 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MSI2-215	ENST00000582453	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	LGALS16	A8MUM7	142 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ACKR2	O00590	384 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	IGKV5-2	P06315	115 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PRR35	P0CG20	571 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	HSD3B1	P14060	373 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	EGR1	P18146	543 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	KEL	P23276	732 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GABRB3	P28472	473 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ABCG1	P45844	678 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GPC5	P78333	572 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	DEUP1	Q05D60	604 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MTAP	Q13126	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	BIRC3	Q13489	604 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	FHL3	Q13643	280 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GCKR	Q14397	625 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PFKFB4	Q16877	469 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	VSTM1	Q6UX27	236 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	G2E3	Q7L622	706 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF398	Q8TD17	642 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CCT6B	Q92526	530 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	C5orf34	Q96MH7	638 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MAGEH1	Q9H213	219 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	FAM234B	A2RU67	622 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GRM8	O00222	908 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	NPHP1	O15259	732 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CBFA2T3	O75081	653 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	RNF8	O76064	485 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	NDST3	O95803	873 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	C4A	P0C0L4	1744 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MPG	P29372	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SERPINF1	P36955	418 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MTX1	Q13505	466 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	DNASE1L3	Q13609	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	KCNJ12	Q14500	433 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	KCNB1	Q14721	858 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SUSD4	Q5VX71	490 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	SMIM5	Q71RC9	77 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	P3H2	Q8IVL5	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MSI2-215	ENST00000582453	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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