RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK10P53779 464 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CHADO15335 359 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 WEE1P30291 646 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RGS21Q2M5E4 152 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf88Q6PI97 169 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MTSS1LQ765P7 747 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 IQGAP1P46940 1657 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PDE9AO76083 593 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 S100A9P06702 114 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 HK2P52789 917 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TGM3Q08188 693 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 HGH1Q9BTY7 390 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL18O94889 574 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CYP1A2P05177 515 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PARP6Q2NL67 630 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ARL10Q8N8L6 244 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ACTRT2Q8TDY3 377 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 AHSPQ9NZD4 102 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MAMLD1Q13495 774 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PLCL1Q15111 1095 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WXM4 84 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH2P05091 517 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3R1P27986 724 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NEK3P51956 506 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 AGAP11Q8TF27 550 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf50Q9BV19 199 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL28Q9NXS3 571 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CENPXA8MT69 81 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PTGES3LE9PB15 166 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L7P0C7H9 530 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 LRPAP1P30533 357 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ISLR2Q6UXK2 745 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ASB2Q96Q27 587 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF21O75509 655 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PPP3CAQ08209 521 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MIIPQ5JXC2 388 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RGS14O43566 566 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CASP7P55210 303 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF3Q13114 568 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RXRGP48443 463 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SLC15A2Q16348 729 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KAT5Q92993 513 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM159Q96B96 161 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NACC2Q96BF6 587 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DYRK3O43781 588 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CLTBP09497 229 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL12Q53G59 568 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CDK20Q8IZL9 346 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 LGI2Q8N0V4 545 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN3BO60391 1043 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FYNP06241 537 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PRKCIP41743 596 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MARK4Q96L34 752 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0B4J269 797 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GRK4P32298 578 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CASP5P51878 434 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms