RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 JCHAINP01591 159 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 C5orf22Q49AR2 442 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 STEAP4Q687X5 459 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXL22Q6P050 247 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCAKDQ8WVC6 231 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAT9Q9BTE0 207 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 PBX4Q9BYU1 374 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 RETREG1Q9H6L5 497 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF212Q9UDV6 495 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RASA4O43374 803 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00271P0C7V0 271 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNB1P14635 433 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 PBX2P40425 430 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSH2P43246 934 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC18A1P54219 525 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 HECTD3Q5T447 861 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 UNC5AQ6ZN44 842 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTD1Q8N815 330 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC44A1Q8WWI5 657 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFAP36Q96G28 342 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGAP3Q96P47 875 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSRAQ9UJ68 235 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMD3O43242 534 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 BRAFP15056 766 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CREB1P16220 341 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFNAR2P48551 515 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.244e-7■■■■■ 34.6
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB30Q15771 203 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPP5Q8N3R9 675 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 GSDMBQ8TAX9 411 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 AZIN2Q96A70 460 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC134Q9H6E4 229 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMA3Q16787 3333 aa29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM120BA0PK00 339 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGAP42A6NI28 874 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CA3P07451 260 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFKB1P19838 968 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 VEPH1Q14D04 833 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa29.06■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ARNTL2Q8WYA1 636 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGSF8Q969P0 613 aa29.05■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZBP1Q9H171 429 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASS4Q9NQ75 786 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 F5H423 210 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ALFQ53S48 1182 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCRL5Q96RD9 977 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC01553A4QN01 128 aa29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF18O76093 207 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTN5O94779 1100 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 HMBSP08397 361 aa29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ELF1P32519 619 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PLD4Q96BZ4 506 aa29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM159BA6NKW6 160 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 AP3B1O00203 1094 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX28O15482 410 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 COCHO43405 550 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT15P19012 456 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAPKAPK2P49137 400 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNQ1P51787 676 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANO4Q32M45 955 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRABDQ9H4I3 376 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC40Q9H9A6 602 aa29.03■■■□□ 2.24
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