RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570124.1

SIN3A-215, Transcript of SIN3 transcription regulator family member A, humanhuman

TSL 2

Gene SIN3A, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3A-215ENST00000570124 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MSRAQ9UJ68 235 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SCN8AQ9UQD0 1980 aa5.56□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 A0A1W2PPC1 479 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SHISA3A0PJX4 238 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 A8MXQ7 604 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TULP2O00295 520 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SYN3O14994 580 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TRAPPC3O43617 180 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SIGLEC6O43699 453 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 BEST1O76090 585 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 OAZ2O95190 189 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SEC24AO95486 1093 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PRAMEF1O95521 474 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 GSNP06396 782 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 RB1P06400 928 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TPM3P06753 285 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SPATA31D3P0C874 917 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CTSAP10619 480 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 KRT5P13647 590 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 P4HA1P13674 534 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CCDC130P13994 396 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 OR1D2P34982 312 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 USP8P40818 1118 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 GPR3P46089 330 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 GLUD2P49448 558 aa5.55□□□□□ -1.52
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SIN3A-215ENST00000570124 ROR1Q01973 937 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SEMA5AQ13591 1074 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PTPN14Q15678 1187 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PSMD5Q16401 504 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CRY1Q16526 586 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TAF3Q5VWG9 929 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FAM171BQ6P995 826 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 LILRA6Q6PI73 481 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CCDC186Q7Z3E2 898 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 METTL23Q86XA0 190 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PALB2Q86YC2 1186 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 DENND1CQ8IV53 801 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FUKQ8N0W3 1084 aa5.55□□□□□ -1.52
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SIN3A-215ENST00000570124 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 STKLD1Q8NE28 680 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PCED1BQ96HM7 432 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SYT15Q9BQS2 421 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SYT11Q9BT88 431 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TTPALQ9BTX7 342 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CRB3Q9BUF7 120 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 NUP58Q9BVL2 599 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 SNX25Q9H3E2 840 aa5.55□□□□□ -1.52
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SIN3A-215ENST00000570124 CYP3A43Q9HB55 503 aa5.55□□□□□ -1.52
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SIN3A-215ENST00000570124 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MTRRQ9UBK8 725 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 POLG2Q9UHN1 485 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.54□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 PLXNA2O75051 1894 aa5.54□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.54□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 ZNF263O14978 683 aa5.54□□□□□ -1.52
SIN3A-215ENST00000570124 TEX28O15482 410 aa5.54□□□□□ -1.52
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