RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	WDR90	Q96KV7	1748 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934		F5H6K3	240 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PODXL	O00592	558 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FOXN1	O15353	648 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB43	O43298	467 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL1	O95922	423 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ASNS	P08243	561 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GABRB3	P28472	473 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ACVRL1	P37023	503 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	NT5C2	P49902	561 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GATM	P50440	423 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PGD	P52209	483 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KLRC3	Q07444	240 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SPP2	Q13103	211 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	BMPR2	Q13873	1038 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	BECN1	Q14457	450 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	STARD3	Q14849	445 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MUL1	Q969V5	352 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PBK	Q96KB5	322 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CPVL	Q9H3G5	476 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KAT14	Q9H8E8	782 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SIPA1L1	O43166	1804 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SCN4A	P35499	1836 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		5	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00473	A8K010	186 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	JAK2	O60674	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	COQ9	O75208	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFB10	O96000	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PDHB	P11177	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	JUP	P14923	745 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	EPHA3	P29320	983 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	NF2	P35240	595 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GRIA3	P42263	894 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GDF5	P43026	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ICA1	Q05084	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	VGLL4	Q14135	290 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM14	Q14142	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GRM4	Q14833	912 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WV62	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	CYTH3	O43739	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	RAMP2	O60895	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM70	O94826	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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