RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555506.1

KTN1-222, Transcript of kinectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene KTN1, Length 1,464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-222	ENST00000555506	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506		A6NCN8	305 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SYN3	O14994	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	GCAT	O75600	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TGM2	P21980	687 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	KCTD2	Q14681	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	EYA3	Q99504	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	JTB	O76095	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	GFPT2	O94808	682 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SGPL1	O95470	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CYP2D6	P10635	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	GSTM2	P28161	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	GJC1	P36383	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SOX10	P56693	466 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	REPS1	Q96D71	796 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	PER2	O15055	1255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TNFSF14	O43557	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CLEC3B	P05452	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CHRM4	P08173	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	UBL4A	P11441	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	IDUA	P35475	653 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	MTNR1A	P48039	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-222	ENST00000555506	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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