RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 GDF3Q9NR23 364 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 VPS18Q9P253 973 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-209ENST00000550857 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-209ENST00000550857 SOBPA7XYQ1 873 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-209ENST00000550857 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ARL5CA6NH57 179 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTC36A6NLP5 189 aa8.2□□□□□ -1.1
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