RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 AGAP2Q99490 1192 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 MECRQ9BV79 373 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 RAD54BQ9Y620 910 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 PATJQ8NI35 1801 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 J3KR12 359 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 PGAM1P18669 254 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 OVGP1Q12889 678 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 PDK4Q16654 411 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC43Q8N309 656 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF276Q8N554 614 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 IPMKQ8NFU5 416 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.4■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ATP2A3Q93084 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
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PRDM4-205ENST00000550376 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ZWINTO95229 277 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 FBXL22Q6P050 247 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 COPEO14579 308 aa21.39■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 SLC18A2Q05940 514 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 CCNCP24863 283 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 PACS1Q6VY07 963 aa21.37■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.37■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.37■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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