RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 MED8Q96G25 268 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 SYCE1LA8MT33 242 aa10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 OR4Q2P0C623 313 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 CASP5P51878 434 aa10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 TAS2R50P59544 299 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 MGAT4DA6NG13 374 aa10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 NDUFA9Q16795 377 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 ESYT3A0FGR9 886 aa10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.731e-8■■■□□ 18.3
POLR1B-217ENST00000541869 BROXQ5VW32 411 aa10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.49□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.49□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 ACTR8Q9H981 624 aa10.49□□□□□ -0.73
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POLR1B-217ENST00000541869 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 CDH3P22223 829 aa10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 MIPP30301 263 aa10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 MAGEA4P43358 317 aa10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 RGS1Q08116 209 aa10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 GNA13Q14344 377 aa10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
POLR1B-217ENST00000541869 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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