RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	FAM87A	P0C7U9	286 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	LCP1	P13796	627 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	TBX4	P57082	545 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	CDKN3	Q16667	212 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	AZIN2	Q96A70	460 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	ABCG4	Q9H172	646 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PQU0	124 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CPED1	A4D0V7	1026 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SPTLC2	O15270	562 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEC1	O60732	1142 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TNFSF15	O95150	251 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CALCA	P01258	141 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC11A2	P49281	568 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RGS7	P49802	495 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	STK38	Q15208	465 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TFAP2B	Q92481	460 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ALG14	Q96F25	216 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	BMF	Q96LC9	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC7A4	O43246	635 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CTSL	P07711	333 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CDH18	Q13634	790 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FGL2	Q14314	439 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FZD2	Q14332	565 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	LGI2	Q8N0V4	545 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SCML4	Q8N228	414 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	POM121B	A6NF01	834 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557		O00370	1275 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RAD51B	O15315	384 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PPP6R2	O75170	966 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PDGFRA	P16234	1089 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT1	P36639	197 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IRAK1	P51617	712 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZSR6	202 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	UBR7	Q8N806	425 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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