RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPA6Q8N4T0 437 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FIBINQ8TAL6 211 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRD9Q9H8M2 597 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SP110Q9HB58 689 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARK1Q9P0L2 795 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.71□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.71□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBX4O00257 560 aa8.7□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFF2Q03403 129 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL10RBQ08334 325 aa8.7□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDAC11Q96DB2 347 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P2RY11Q96G91 374 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSGA13Q96PP4 275 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.7□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.7□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf60A6NFR6 353 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF103O00237 685 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MATN3O15232 486 aa8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAFKO60675 156 aa8.69□□□□□ -1.02
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