RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	VAT1	Q99536	393 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SMAP	O00193	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RNF103	O00237	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	DFFA	O00273	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MATN3	O15232	486 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OPHN1	O60890	802 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RAMP2	O60895	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PEX11B	O96011	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PTPN3	P26045	913 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ACTN2	P35609	894 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ITGA8	P53708	1063 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	USP4	Q13107	963 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CBLB	Q13191	982 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CPT1B	Q92523	772 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MAML1	Q92585	1016 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	KCNK1	O00180	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TSPAN3	O60637	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FSHR	P23945	695 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TNK2	Q07912	1038 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SERINC3	Q13530	473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FMO2	Q99518	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CACNG3	O60359	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	METTL18	O95568	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GNA12	Q03113	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MREG	Q8N565	214 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FGF13	Q92913	245 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766		A0A0D9SEW6	157 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CHAD	O15335	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TBL1X	O60907	577 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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