RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GEN1Q17RS7 908 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC27Q6P3X3 843 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NXPE3Q969Y0 559 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 OLFM3Q96PB7 478 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS28Q9UK41 221 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 OR51B4Q9Y5P0 310 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ILVBLA1L0T0 632 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CISD3P0C7P0 127 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NDST2P52849 883 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT2Q10471 571 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 LINGO4Q6UY18 593 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 LZTR1Q8N653 840 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ALG14Q96F25 216 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CARD6Q9BX69 1037 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CD320Q9NPF0 282 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 GGA2Q9UJY4 613 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CBX4O00257 560 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 LIASO43766 372 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 RBP3P10745 1247 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 DGKGP49619 791 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1B1Q10567 949 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 FUT11Q495W5 492 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM215Q68D42 235 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP41Q9BYV8 373 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 VAV1P15498 845 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 NR2C2P49116 596 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF14Q9UBS8 474 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO10Q9UK96 956 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK1O00180 336 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MCF2LO15068 1137 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SERINC3Q13530 473 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PARP15Q460N3 678 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEH1Q9H213 219 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 DEC1Q9P2X7 70 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MAFKO60675 156 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CD72P21854 359 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 RBL1P28749 1068 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PDK1Q15118 436 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNG2Q16589 344 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC13Q8NBP0 860 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.25■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF10P55107 478 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF135Q8IUD6 432 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 USP33Q8TEY7 942 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT12Q99456 494 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 DONSONQ9NYP3 566 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 COL4A3Q01955 1670 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO10Q9HD67 2058 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PRRT4C9JH25 899 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MT-CO1P00395 513 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SRFP11831 508 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 GALK1P51570 392 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS51Q9UID3 782 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 MX2P20592 715 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms