RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHRNB4P30926 498 aa0.49□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 AVPR1AP37288 418 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 PGFP49763 221 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 MXI1P50539 228 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBL2Q08999 1139 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZBTB17Q13105 803 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TUBD1Q9UJT1 453 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NTSR2O95665 410 aa0.48□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 RBL1P28749 1068 aa0.48□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM49CP0CI26 452 aa0.47□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 MIGA1Q8NAN2 632 aa0.47□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 THAP4Q8WY91 577 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 FIG4Q92562 907 aa0.47□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 SYT11Q9BT88 431 aa0.47□□□□□ -2.33
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF224Q9NZL3 707 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 DKK4Q9UBT3 224 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF711Q9Y462 761 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD2APQ9Y5K6 639 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP69A5D8W1 941 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASPDHA6ND91 283 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC14BA6NHZ5 514 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-162P-201ENST00000516228 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
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