RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	PLK1	P53350	603 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RWDD2B	P57060	319 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GNG11	P61952	73 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DYNLT1	P63172	113 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARF5	P84085	180 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GNA12	Q03113	381 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PRKCQ	Q04759	706 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CDH18	Q13634	790 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CCIN	Q13939	588 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RPS6KA1	Q15418	735 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PTPRN	Q16849	979 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MBLAC2	Q68D91	279 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RFX6	Q8HWS3	928 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ILVBL	A1L0T0	632 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM221	A6NGB7	291 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	WASH3P	C4AMC7	463 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		J3KR12	359 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		K7ERQ8	282 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107		M0R296	226 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF185	O15231	689 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DAPK3	O43293	454 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	14.91	□□□□□ -0.02	2e-7	■■□□□ 13
MATR3-238	ENST00000512107	HTR7	P34969	479 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARL4A	P40617	200 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GRIA2	P42262	883 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MAPKAPK2	P49137	400 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LINGO4	Q6UY18	593 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	COG1	Q8WTW3	980 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TTC17	Q96AE7	1141 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HAUS1	Q96CS2	278 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MS4A14	Q96JA4	679 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	VPS51	Q9UID3	782 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FAM170B	A6NMN3	283 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF487	B1APH4	448 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KIF5C	O60282	957 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CST8	O60676	142 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PEX11B	O96011	259 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	APOD	P05090	189 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	WAS	P42768	502 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PPP2R5E	Q16537	467 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF366	Q8N895	744 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	VOPP1	Q96AW1	172 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SPON2	Q9BUD6	331 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PDF	Q9HBH1	243 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DTL	Q9NZJ0	730 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CACNA1A	O00555	2505 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	RNF103	O00237	685 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	KCNK3	O14649	394 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	RAMP2	O60895	175 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	ADAM23	O75077	832 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	RNF40	O75150	1001 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	VAV1	P15498	845 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	PTPN7	P35236	360 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	TIE1	P35590	1138 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MATR3-238	ENST00000512107	AMPD2	Q01433	879 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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