RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 LTBP1Q14766 1721 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CHADO15335 359 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL16O15467 120 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MED24O75448 989 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 APOA4P06727 396 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RAC2P15153 192 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MYOGP15173 224 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TYMPP19971 482 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGEA4P43358 317 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CASP4P49662 377 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT39Q6A163 491 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MZT2AQ6P582 158 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ERICH1Q86X53 443 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC71Q8N4P6 559 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 EBF2Q9HAK2 575 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNK12Q9HB15 430 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HAO1Q9UJM8 370 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 M0R2N6 131 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB39O15060 712 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 GUCA1CO95843 209 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT16P08779 473 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CPEP16870 476 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPN4P29074 926 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NEK2P51955 445 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BNIP1Q12981 228 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PRKG2Q13237 762 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TCEA2Q15560 299 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PARP6Q2NL67 630 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF605Q86T29 641 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PASD1Q8IV76 773 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZWILCHQ9H900 591 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NPHS2Q9NP85 383 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NFS1Q9Y697 457 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.03□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.02□□□□□ -1.77
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ANKRD28-213ENST00000498524 CYP26A1O43174 497 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PFDN1O60925 122 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT37O76014 449 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MLYCDO95822 493 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 APOEP02649 317 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ITGAVP06756 1048 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GALTP07902 379 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NFICP08651 508 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CYP3A4P08684 503 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SERPINB6P35237 376 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GRIK1P39086 918 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MATKP42679 507 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ARL4DP49703 201 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 COG7P83436 770 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GPS1Q13098 491 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 BLMHQ13867 455 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RCN1Q15293 331 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HIF1AQ16665 826 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 P3H1Q32P28 736 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.02□□□□□ -1.77
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