RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.96□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ACOT9Q9Y305 439 aa14.96□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 MYADML2A6NDP7 307 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SPAG7O75391 227 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SUPT7LO94864 414 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TNNI3P19429 210 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 INAVAQ3KP66 663 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TDP1Q9NUW8 608 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TFR2Q9UP52 801 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZBTB14O43829 449 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF623O75123 536 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CALCAP01258 141 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 KCNE1P15382 129 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ANKS6Q68DC2 871 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RUBCNQ92622 972 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 AHSPQ9NZD4 102 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 NID2Q14112 1375 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 A0A088AWK7 358 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GPC1P35052 558 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PCK1P35558 622 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CAPN10Q9HC96 672 aa14.95□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 E2F8A0AVK6 867 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 USP27XA6NNY8 438 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RAD51CO43502 376 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RBP1P09455 135 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SLC20A2Q08357 652 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 STX3Q13277 289 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ITGA9Q13797 1035 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PARP6Q2NL67 630 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CCDC38Q502W7 563 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 STK32AQ8WU08 396 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 HES6Q96HZ4 224 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF670Q9BS34 389 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GKN1Q9NS71 199 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 KPNA5O15131 536 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ATG7O95352 703 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PIGRP01833 764 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RHOQP17081 205 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 KRT20P35900 424 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RABGGTBP53611 331 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PARP15Q460N3 678 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CXorf38Q8TB03 319 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ABHD8Q96I13 439 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 AGRPO00253 132 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 UBE3AQ05086 875 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 MRGBPQ9NV56 204 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 VAPBO95292 243 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RUBCNLQ9H714 662 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.94□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 BTAF1O14981 1849 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 E2F6O75461 281 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 DCTN3O75935 186 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 STBD1O95210 358 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GJA8P48165 433 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 FMO1Q01740 532 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 HMGB4Q8WW32 186 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SEMA4DQ92854 862 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 GJA1P17302 382 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 RBL1P28749 1068 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.93□□□□□ -0.02
FAAP20-214ENST00000497675 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms