RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTN2	P35609	894 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF11	P52732	1056 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF4B	Q92750	862 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF11	Q92914	225 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A18	Q96N87	628 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LGMN	Q99538	433 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	HHLA1	C9JL84	531 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	YKT6	O15498	198 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	VNN1	O95497	513 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CD58	P19256	250 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	STK38	Q15208	465 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	BROX	Q5VW32	411 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	BPTF	Q12830	3046 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	BRINP1	O60477	761 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GLDC	P23378	1020 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-F	P30511	346 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPA	P45381	313 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ACADVL	P49748	655 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC8A3	P57103	927 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RTP5	Q14D33	572 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	IQUB	Q8NA54	791 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	OMD	Q99983	421 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KNTC1	P50748	2209 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPC4	97 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-34	P06331	123 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CD38	P28907	300 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF445	P59923	1031 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DLG4	P78352	724 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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